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1966年開始的“文化大革命”，使北京農(nóng)業(yè)科研事業(yè)飽受催殘。科技人員下放勞動，接受“再教育”，1968年11月原來的8個獨立的研究所被精簡合并為北京市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所，科研隊伍由幾百人削減到百十多人，科研儀器、資料大量失落，打亂了正常的科研秩序。

1971年初，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院將該院作物育種栽培研究所、蔬菜研究所和農(nóng)業(yè)氣象研究室下放到北京市，與北京市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所的相關(guān)研究室合并。這使北京市農(nóng)業(yè)科研力量得到了充實，北京市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所的職工總數(shù)達700余人，其中研究人員470人。全所下設(shè)作物、蔬菜、畜牧獸醫(yī)、土肥、農(nóng)機化、新技術(shù)、氣象等7個專業(yè)研究室。全所科研人 ......