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1978年， 中共十一屆三中全會(huì)和全國(guó)科學(xué)大會(huì)召開。在鄧小平同志“科學(xué)技術(shù)是第一生產(chǎn)力”和“知識(shí)分子是工人階級(jí)的一部分”的思想指引下，福建農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu)得到全面加強(qiáng)，農(nóng)業(yè)科研進(jìn)入一個(gè)新的發(fā)展階段。

1.農(nóng)業(yè)。1978年，福建省農(nóng)科院將土壤肥料、耕作輪作、植物保護(hù)等3個(gè)研究室擴(kuò)大為研究所。1979年3月，把科技情報(bào)處改建為科技情報(bào)研究所。1980年5月成立地?zé)徂r(nóng)業(yè)利用研究所。1983年3月，福建省農(nóng)科院與農(nóng)牧漁業(yè)部合辦福建省農(nóng)科院紅萍研究中心。福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院現(xiàn)轄稻麥、果樹、茶葉、甘蔗、土壤肥料、植物保護(hù)、地?zé)徂r(nóng)業(yè)利用、畜牧獸醫(yī)、科技情報(bào)等10個(gè)研究所和中心實(shí)驗(yàn)室、紅萍 ......