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該所建于1957年。初為安徽省棉花試驗站(站址于濉溪縣)，隸屬安徽省農(nóng)業(yè)廳領(lǐng)導(dǎo)，后改為淮北棉花研究所;1962年收歸安徽省農(nóng)科院領(lǐng)導(dǎo);1964年遷址安慶市郊，改為安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院安慶棉花研究所;1969年下放為安慶市代管;1978年4月收歸安徽省農(nóng)林科學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)，更名為安徽省農(nóng)林科學(xué)院安慶棉花研究所;1978年底，更名為安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院安慶棉花研究所;1995年更為現(xiàn)名。下設(shè)栽培、育種、植保和化驗等4個研究室，還設(shè)有辦公室和開發(fā)部。擁有科研用地8.7公頃和常規(guī)生物生化測試分析儀器。

該所有職工54人，其中技術(shù)干部31人，高級研究人員5人，中級研究人員18人。主要任務(wù)是，進行棉花優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)多抗新品 ......